Sinopsis Bungou Stray Dogs 3rd Season: Menyusul berakhirnya perang organisasi tiga arah, birokrat pemerintah Ango Sakaguchi mengenang peristiwa yang terjadi beberapa tahun lalu, setelah kematian mantan bos Mafia Pelabuhan. Osamu Dazai, yang saat itu masih menjadi rekrutan baru, ditugaskan untuk menyelidiki rumor terkait ledakan misterius yang menghancurkan sebagian kota beberapa tahun lalu—dan hubungannya dengan dugaan kemunculan kembali mantan bosnya.
Karena keadaan di luar kendalinya, ia bermitra dengan Chuuya Nakahara, pemimpin klan saingan yang berbakat namun impulsif yang dikenal sebagai Domba, untuk mengungkap kebenaran di balik kasus tersebut dan menyoroti mitos Arahabaki—dewa api yang mungkin saja mengarahkan Dazai ke solusi kasus tersebut.
Sementara itu, saat ini Badan Reserse Bersenjata kembali berjalan seperti biasa. Namun perpecahan damai mereka tidak akan berlangsung lama, karena musuh lama dan baru mengumpulkan kekuatan mereka dan bersiap untuk pertarungan berikutnya.
